Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP6Q96FZ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP6Q96FZ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP6Q96FZ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHMP6Q96FZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMP6Q96FZ7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHMP6Q96FZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHMP6Q96FZ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHMP6Q96FZ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms