Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE3

SEH1L, Nucleoporin SEH1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1LQ96EE3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEH1LQ96EE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEH1LQ96EE3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEH1LQ96EE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEH1LQ96EE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEH1LQ96EE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEH1LQ96EE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms