Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PABPC5Q96DU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC5Q96DU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC5Q96DU9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC5Q96DU9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC5Q96DU9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PABPC5Q96DU9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC5Q96DU9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms