Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APH1AQ96BI3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APH1AQ96BI3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APH1AQ96BI3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APH1AQ96BI3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APH1AQ96BI3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APH1AQ96BI3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms