Protein–RNA interactions for Protein: Q96BH1

RNF25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF25Q96BH1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF25Q96BH1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF25Q96BH1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF25Q96BH1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF25Q96BH1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF25Q96BH1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RNF25Q96BH1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RNF25Q96BH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF25Q96BH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF25Q96BH1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RNF25Q96BH1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms