Protein–RNA interactions for Protein: Q92979

EMG1, Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMG1Q92979 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMG1Q92979 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EMG1Q92979 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EMG1Q92979 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EMG1Q92979 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EMG1Q92979 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMG1Q92979 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms