Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S1Q92572 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3S1Q92572 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AP3S1Q92572 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AP3S1Q92572 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3S1Q92572 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3S1Q92572 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3S1Q92572 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms