Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
TOPBP1Q92547 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
TOPBP1Q92547 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
TOPBP1Q92547 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
TOPBP1Q92547 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
TOPBP1Q92547 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
TOPBP1Q92547 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
TOPBP1Q92547 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
TOPBP1Q92547 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
TOPBP1Q92547 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
TOPBP1Q92547 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.2■■■■■ 4.99
TOPBP1Q92547 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC46.19■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC46.16■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
TOPBP1Q92547 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC46.13■■■■■ 4.97
TOPBP1Q92547 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
TOPBP1Q92547 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
TOPBP1Q92547 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
TOPBP1Q92547 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC46.06■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
TOPBP1Q92547 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC46■■■■■ 4.95
TOPBP1Q92547 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
TOPBP1Q92547 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
TOPBP1Q92547 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
TOPBP1Q92547 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
TOPBP1Q92547 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC45.94■■■■■ 4.95
TOPBP1Q92547 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
TOPBP1Q92547 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
TOPBP1Q92547 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC45.81■■■■■ 4.92
TOPBP1Q92547 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
TOPBP1Q92547 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.8■■■■■ 4.92
TOPBP1Q92547 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
TOPBP1Q92547 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
TOPBP1Q92547 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
TOPBP1Q92547 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC45.7■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.91
TOPBP1Q92547 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
TOPBP1Q92547 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
TOPBP1Q92547 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
TOPBP1Q92547 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
TOPBP1Q92547 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
TOPBP1Q92547 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC45.65■■■■■ 4.9
TOPBP1Q92547 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms