Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNAJA4Q8WW22 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJA4Q8WW22 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJA4Q8WW22 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJA4Q8WW22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAJA4Q8WW22 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAJA4Q8WW22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms