Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
WDR60Q8WVS4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
WDR60Q8WVS4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
WDR60Q8WVS4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR60Q8WVS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR60Q8WVS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR60Q8WVS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WDR60Q8WVS4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms