Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE7

TMEM170A, Transmembrane protein 170A, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170AQ8WVE7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM170AQ8WVE7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM170AQ8WVE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM170AQ8WVE7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM170AQ8WVE7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM170AQ8WVE7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms