Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFT2D1Q8WV19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFT2D1Q8WV19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFT2D1Q8WV19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SFT2D1Q8WV19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SFT2D1Q8WV19 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SFT2D1Q8WV19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms