Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB2BQ8WUD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB2BQ8WUD1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB2BQ8WUD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB2BQ8WUD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB2BQ8WUD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB2BQ8WUD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB2BQ8WUD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms