Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HELQQ8TDG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HELQQ8TDG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HELQQ8TDG4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HELQQ8TDG4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HELQQ8TDG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HELQQ8TDG4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HELQQ8TDG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms