Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGR3Q8TD06 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGR3Q8TD06 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGR3Q8TD06 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AGR3Q8TD06 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AGR3Q8TD06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AGR3Q8TD06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AGR3Q8TD06 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms