Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNIH3Q8TBE1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNIH3Q8TBE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNIH3Q8TBE1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNIH3Q8TBE1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNIH3Q8TBE1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNIH3Q8TBE1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNIH3Q8TBE1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNIH3Q8TBE1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.2 ms