Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GSDMBQ8TAX9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GSDMBQ8TAX9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GSDMBQ8TAX9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSDMBQ8TAX9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSDMBQ8TAX9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSDMBQ8TAX9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSDMBQ8TAX9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GSDMBQ8TAX9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms