Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APPL2Q8NEU8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
APPL2Q8NEU8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APPL2Q8NEU8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
APPL2Q8NEU8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
APPL2Q8NEU8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APPL2Q8NEU8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APPL2Q8NEU8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms