Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE71

ABCF1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 845 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF1Q8NE71 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.992e-6■□□□□ 11.2
ABCF1Q8NE71 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-6■□□□□ 11.2
ABCF1Q8NE71 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 224.91■■□□□ 1.583e-14■□□□□ 11.1
ABCF1Q8NE71 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.83e-14■□□□□ 11.1
ABCF1Q8NE71 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.83e-6■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.291e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.181e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)21.02■□□□□ 0.961e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.421e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.151e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.151e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 TNPO2-206ENST00000587068 377 ntTSL 215.1■□□□□ 0.011e-17■□□□□ 10.9
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 413.57□□□□□ -0.242e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.342e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.442e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.492e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 211.42□□□□□ -0.582e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.782e-23■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC10.2□□□□□ -0.786e-11■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.36e-11■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.516e-11■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.92□□□□□ -1.786e-11■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 315□□□□□ -0.012e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 414.8□□□□□ -0.042e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 412.03□□□□□ -0.482e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.712e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.842e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 59.66□□□□□ -0.862e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.922e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 58.92□□□□□ -0.982e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-7■□□□□ 10.7
ABCF1Q8NE71 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-9■□□□□ 10.6
ABCF1Q8NE71 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-9■□□□□ 10.6
ABCF1Q8NE71 ABO-201ENST00000453660 6341 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.121e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 UBE2D2-204ENST00000505007 1170 ntTSL 328.88■■■□□ 2.215e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.795e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.545e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.415e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.285e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 MYC-203ENST00000517291 1023 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.155e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.125e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.685e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-7■□□□□ 10.5
ABCF1Q8NE71 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)28.13■■■□□ 2.092e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 PIEZO1-210ENST00000491917 406 ntTSL 234.38■■■■□ 3.094e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.474e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 EIF3B-203ENST00000413917 962 ntTSL 230.14■■■□□ 2.424e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 SOS1-204ENST00000451331 579 ntTSL 424.32■■□□□ 1.484e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.434e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 MVD-209ENST00000565149 2352 ntTSL 1 (best)23.37■■□□□ 1.334e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.284e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.114e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.534e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.634e-6■□□□□ 10.4
ABCF1Q8NE71 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.385e-21■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 TSR1-203ENST00000575049 387 ntTSL 36.1□□□□□ -1.435e-21■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.57□□□□□ -1.525e-21■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 SNORD91B-201ENST00000391250 95 nt3.72□□□□□ -1.815e-21■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.785e-8■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.585e-8■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 310.09□□□□□ -0.792e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.982e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 36.71□□□□□ -1.342e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 26.2□□□□□ -1.422e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 25□□□□□ -1.612e-25■□□□□ 10.3
ABCF1Q8NE71 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.022e-6■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-218ENST00000578380 310 ntTSL 331.98■■■□□ 2.713e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.713e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.283e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 228.39■■■□□ 2.143e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.133e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-228ENST00000584141 564 ntTSL 227.88■■■□□ 2.053e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-203ENST00000472367 794 ntTSL 326.77■■□□□ 1.883e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-212ENST00000483588 688 ntTSL 325.58■■□□□ 1.693e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-229ENST00000584177 574 ntTSL 425.06■■□□□ 1.63e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.983e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.863e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.813e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-206ENST00000477249 891 ntTSL 519.64■□□□□ 0.733e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-219ENST00000578757 920 ntTSL 1 (best)19.64■□□□□ 0.733e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-217ENST00000497774 1662 ntTSL 518.75■□□□□ 0.593e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-207ENST00000478103 712 ntTSL 315.79■□□□□ 0.123e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-227ENST00000583400 712 ntTSL 415.31■□□□□ 0.043e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-222ENST00000580770 572 ntTSL 415.24■□□□□ 0.033e-18■□□□□ 10.2
ABCF1Q8NE71 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 315.24■□□□□ 0.033e-18■□□□□ 10.2
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