Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms