Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT2

TDRD5, Tudor domain-containing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD5Q8NAT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TDRD5Q8NAT2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TDRD5Q8NAT2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TDRD5Q8NAT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TDRD5Q8NAT2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TDRD5Q8NAT2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TDRD5Q8NAT2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms