Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNX31Q8N9S9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNX31Q8N9S9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNX31Q8N9S9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX31Q8N9S9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX31Q8N9S9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SNX31Q8N9S9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms