Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D7

NKAIN3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKAIN3Q8N8D7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKAIN3Q8N8D7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKAIN3Q8N8D7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NKAIN3Q8N8D7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NKAIN3Q8N8D7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKAIN3Q8N8D7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKAIN3Q8N8D7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKAIN3Q8N8D7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKAIN3Q8N8D7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKAIN3Q8N8D7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKAIN3Q8N8D7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms