Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NANOGP1Q8N7R0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NANOGP1Q8N7R0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NANOGP1Q8N7R0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NANOGP1Q8N7R0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP1Q8N7R0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP1Q8N7R0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NANOGP1Q8N7R0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NANOGP1Q8N7R0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NANOGP1Q8N7R0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NANOGP1Q8N7R0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms