Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M3

FITM2, Fat storage-inducing transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FITM2Q8N6M3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FITM2Q8N6M3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FITM2Q8N6M3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FITM2Q8N6M3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FITM2Q8N6M3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FITM2Q8N6M3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FITM2Q8N6M3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FITM2Q8N6M3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FITM2Q8N6M3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FITM2Q8N6M3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FITM2Q8N6M3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FITM2Q8N6M3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FITM2Q8N6M3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms