Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5I2

ARRDC1, Arrestin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1Q8N5I2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARRDC1Q8N5I2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ARRDC1Q8N5I2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARRDC1Q8N5I2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC1Q8N5I2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARRDC1Q8N5I2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARRDC1Q8N5I2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms