Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC24Q8N4L8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC24Q8N4L8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC24Q8N4L8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC24Q8N4L8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC24Q8N4L8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC24Q8N4L8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC24Q8N4L8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC24Q8N4L8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC24Q8N4L8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms