Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MFSD4AQ8N468 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MFSD4AQ8N468 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD4AQ8N468 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD4AQ8N468 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MFSD4AQ8N468 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD4AQ8N468 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD4AQ8N468 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD4AQ8N468 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms