Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SYCP3Q8IZU3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SYCP3Q8IZU3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SYCP3Q8IZU3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP3Q8IZU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP3Q8IZU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SYCP3Q8IZU3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYCP3Q8IZU3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP3Q8IZU3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYCP3Q8IZU3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYCP3Q8IZU3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYCP3Q8IZU3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYCP3Q8IZU3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYCP3Q8IZU3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms