Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMNTD2Q8IXW0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMNTD2Q8IXW0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMNTD2Q8IXW0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMNTD2Q8IXW0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMNTD2Q8IXW0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms