Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC50Q8IVM0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC50Q8IVM0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC50Q8IVM0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC50Q8IVM0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC50Q8IVM0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC50Q8IVM0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC50Q8IVM0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms