Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL1

NAV2, Neuron navigator 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAV2Q8IVL1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAV2Q8IVL1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAV2Q8IVL1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NAV2Q8IVL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NAV2Q8IVL1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAV2Q8IVL1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAV2Q8IVL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAV2Q8IVL1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAV2Q8IVL1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms