Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD163Q86VB7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD163Q86VB7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD163Q86VB7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD163Q86VB7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD163Q86VB7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD163Q86VB7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD163Q86VB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD163Q86VB7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms