Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM220AQ7Z4H9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM220AQ7Z4H9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM220AQ7Z4H9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM220AQ7Z4H9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM220AQ7Z4H9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM220AQ7Z4H9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM220AQ7Z4H9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM220AQ7Z4H9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM220AQ7Z4H9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM220AQ7Z4H9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM220AQ7Z4H9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM220AQ7Z4H9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms