Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H3

HDDC2, HD domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2Q7Z4H3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDDC2Q7Z4H3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDDC2Q7Z4H3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HDDC2Q7Z4H3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HDDC2Q7Z4H3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDDC2Q7Z4H3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDDC2Q7Z4H3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDDC2Q7Z4H3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms