Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
ATG9AQ7Z3C6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ATG9AQ7Z3C6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ATG9AQ7Z3C6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ATG9AQ7Z3C6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATG9AQ7Z3C6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATG9AQ7Z3C6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ATG9AQ7Z3C6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms