Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHFQ7M4L6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHFQ7M4L6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SHFQ7M4L6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHFQ7M4L6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHFQ7M4L6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHFQ7M4L6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms