Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARCQ7LC44 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARCQ7LC44 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARCQ7LC44 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARCQ7LC44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARCQ7LC44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARCQ7LC44 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARCQ7LC44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms