Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP43Q70EL4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP43Q70EL4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP43Q70EL4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP43Q70EL4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP43Q70EL4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP43Q70EL4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms