Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PDZRN4Q6ZMN7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PDZRN4Q6ZMN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PDZRN4Q6ZMN7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDZRN4Q6ZMN7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN4Q6ZMN7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZRN4Q6ZMN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN4Q6ZMN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDZRN4Q6ZMN7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms