Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MUC6Q6W4X9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MUC6Q6W4X9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MUC6Q6W4X9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MUC6Q6W4X9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MUC6Q6W4X9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MUC6Q6W4X9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MUC6Q6W4X9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MUC6Q6W4X9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MUC6Q6W4X9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms