Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD4L3Q6VB84 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD4L3Q6VB84 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD4L3Q6VB84 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD4L3Q6VB84 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD4L3Q6VB84 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD4L3Q6VB84 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD4L3Q6VB84 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD4L3Q6VB84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD4L3Q6VB84 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FOXD4L3Q6VB84 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FOXD4L3Q6VB84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms