Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SUSD1Q6UWL2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SUSD1Q6UWL2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SUSD1Q6UWL2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SUSD1Q6UWL2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SUSD1Q6UWL2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms