Protein–RNA interactions for Protein: Q6PH81

C16orf87, UPF0547 protein C16orf87, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf87Q6PH81 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C16orf87Q6PH81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C16orf87Q6PH81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C16orf87Q6PH81 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C16orf87Q6PH81 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C16orf87Q6PH81 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C16orf87Q6PH81 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C16orf87Q6PH81 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms