Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLC3Q6P597 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KLC3Q6P597 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KLC3Q6P597 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLC3Q6P597 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLC3Q6P597 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLC3Q6P597 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLC3Q6P597 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLC3Q6P597 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms