Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASC4Q6P4E1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CASC4Q6P4E1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CASC4Q6P4E1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CASC4Q6P4E1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CASC4Q6P4E1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASC4Q6P4E1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CASC4Q6P4E1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC4Q6P4E1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CASC4Q6P4E1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms