Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2D0

ZFP1, Zinc finger protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP1Q6P2D0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP1Q6P2D0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP1Q6P2D0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP1Q6P2D0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZFP1Q6P2D0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFP1Q6P2D0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZFP1Q6P2D0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFP1Q6P2D0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFP1Q6P2D0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFP1Q6P2D0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP1Q6P2D0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFP1Q6P2D0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP1Q6P2D0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFP1Q6P2D0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP1Q6P2D0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZFP1Q6P2D0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms