Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf33Q6P1S2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf33Q6P1S2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C3orf33Q6P1S2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C3orf33Q6P1S2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C3orf33Q6P1S2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf33Q6P1S2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf33Q6P1S2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf33Q6P1S2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms