Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL13AP3Q6NVV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL13AP3Q6NVV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL13AP3Q6NVV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL13AP3Q6NVV1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPL13AP3Q6NVV1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPL13AP3Q6NVV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPL13AP3Q6NVV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms