Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6AWC8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6AWC8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6AWC8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q6AWC8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6AWC8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q6AWC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6AWC8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6AWC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6AWC8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q6AWC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q6AWC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6AWC8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q6AWC8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6AWC8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6AWC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q6AWC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6AWC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6AWC8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q6AWC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6AWC8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6AWC8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6AWC8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Q6AWC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6AWC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6AWC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q6AWC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Q6AWC8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6AWC8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6AWC8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6AWC8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6AWC8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q6AWC8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6AWC8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6AWC8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6AWC8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6AWC8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6AWC8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q6AWC8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6AWC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Q6AWC8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6AWC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Q6AWC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Q6AWC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6AWC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Q6AWC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q6AWC8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q6AWC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q6AWC8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Q6AWC8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q6AWC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q6AWC8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q6AWC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Q6AWC8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6AWC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Q6AWC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6AWC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6AWC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6AWC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6AWC8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6AWC8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q6AWC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6AWC8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6AWC8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6AWC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6AWC8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q6AWC8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q6AWC8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q6AWC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q6AWC8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q6AWC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q6AWC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q6AWC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q6AWC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q6AWC8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q6AWC8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q6AWC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q6AWC8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q6AWC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q6AWC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q6AWC8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q6AWC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q6AWC8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q6AWC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q6AWC8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q6AWC8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms